La FQ cuenta con la sede principal y otras instalaciones.
Sede principal
La sede principal de la Facultad de Química se encuentra en el Conjunto principal en el que se encuentran los edificios A, B, C y F. Este Conjunto está ubicado dentro del campus universitario en Circuito Interior, Ciudad Universitaria, Colonia Copilco Coyoacán, C.P. 04510, Delegación Coyoacán.
También cuenta con los Conjuntos D y E que se encuentran en Ciudad Universitaria en la dirección Circuito de la Investigación Científica, Ciudad Universitaria, Colonia Copilco Coyoacán, C.P. 04510, Delegación Coyoacán.
Recientemente se inauguró el edificio H “Mario Molina”, ubicado en Circuito Mario de la Cueva s/n esquina Circuito Investigación Científica, Ciudad Universitaria.
Está en proceso la construcción de un nuevo edificio de aulas y laboratorios que se ubicará a un costado del Edificio H y que se inaugurará en 2024.
Tacuba
El edificio original donde inició la Escuela de Química Industrial, continúa activa y está ubicado en Mar del Norte #5, Colonia San Álvaro Tacuba, en la Delegación Azcapotzalco, C.P. 09010.
Mérida
La Facultad cuenta con una estación foránea, en Sisal, Mérida, Yucatán.
Monterrey
La facultad también cuenta con el Centro Polo Universitario de Tecnología Avanzada (PUNTA) ubicado en el Parque de Investigación e Innovación Tecnológica (PIIT) en Apodaca, Nuevo León. Este complejo facilita la transferencia del conocimiento tecnológico, de investigación, de recursos humanos y culturales generados en la universidad a instituciones públicas, privadas y empresas.